home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00362 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.1 KB  |  46 lines
  1. ****************************
  2. * Dynamin family signature *
  3. ****************************
  4.  
  5. Dynamin [1,2] is  a  microtubule-associated force-producing  protein of 100 Kd
  6. which is involved in  the  production of microtubule bundles and which is able
  7. to bind and hydrolyze GTP.  Dynamin  is structurally related  to the following
  8. proteins:
  9.  
  10.  - Drosophila shibire  protein (gene shi) [3].  Shibire is, very probably, the
  11.    Drosophila cognate of mammalian dynamin.  It seems to provide the motor for
  12.    vesicular transport during endocytosis.
  13.  - Yeast vacuolar  sorting protein VPS1 (or SPO15) [4], a protein which  could
  14.    also be involved in microtubule-associated motility.
  15.  - Yeast  protein  MGM1  [5],  which  is  required  for  mitochondrial  genome
  16.    maintenance.
  17.  - Interferon induced Mx proteins [6,7].  Interferon alpha  or beta induce the
  18.    synthesis of a family of closely related proteins.  Most  of these proteins
  19.    are known to confer resistance to influenza viruses and/or rhabdoviruses on
  20.    transfected mammalian cell in culture.
  21.  
  22. The  three  motifs  found  in  all  GTP-binding proteins are located in the N-
  23. terminal part of these proteins.   The signature pattern that we developed for
  24. these proteins  is  based  on  a  highly  conserved  region  downstream of the
  25. ATP/GTP-binding motif 'A' (P-loop).
  26.  
  27. -Consensus pattern: L-P-[RK]-G-[STN]-[GN]-[LIVM]-V-T-R
  28. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  30. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  31.  
  32. [ 1] Vallee R.B., Shpetner H.S.
  33.      Annu. Rev. Biochem. 59:909-932(1990).
  34. [ 2] Obar R.A., Collins C.A., Hammarback J.A., Shpetner H.S., Vallee R.B.
  35.      Nature 347:256-261(1990).
  36. [ 3] van der Bliek A., Meyerowitz E.M.
  37.      Nature 351:411-414(1991).
  38. [ 4] Rothman J.H., Raymond C.K., Gilbert T., O'Hara P.J., Stevens T.H.
  39.      Cell 61:1063-1074(1990).
  40. [ 5] Jones B.A., Fangman W.L.
  41.      Genes Dev. 6:380-389(1992).
  42. [ 6] Arnheiter H., Meier E.
  43.      New Biol. 2:851-857(1990).
  44. [ 7] Staeheli P., Pitossi F., Pavlovic J.
  45.      Trends Cell Biol. 3:268-272(1993).
  46.